Difference between revisions of "Validations nematodes"

From Hackuarium
Jump to navigation Jump to search
 
(14 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 1: Line 1:
version FR (doit avoir nématodes!! - les titres des pages wiki sont pas toujours les mieux!)
+
version FR (doit avoir 'nématodes' dans le titre dessus - bien sûr !)*
  
 
Voici le [[Worm validations|lien vers la version anglais]].
 
Voici le [[Worm validations|lien vers la version anglais]].
  
En rapport avec la validation de l'inactivation des OGM par l'eau de Javel - sur les nématodes.
+
Cette page est un résumé simplifié concernant la validation de la [https://drive.google.com/file/d/1_db3H7Ybm_kd7yV-wnMKF55Snr805TAp/view?usp=sharing procédure opératoire standardisée utilisée pour inactiver les organismes génétiquement modifiés (OGM) à l'aide d'eau de Javel], en vue de leur utilisation sur des vers nématodes.
 +
 
  
 
[https://wiki.hackuarium.ch/images/5/56/Nematodes1_smaller.pdf l'expérience de validation p1]
 
[https://wiki.hackuarium.ch/images/5/56/Nematodes1_smaller.pdf l'expérience de validation p1]
  
 
[https://wiki.hackuarium.ch/images/5/50/Nematodes2_smaller.pdf l'expérience de validation p2]
 
[https://wiki.hackuarium.ch/images/5/50/Nematodes2_smaller.pdf l'expérience de validation p2]
 +
 +
 +
 +
Pour [https://www.evernote.com/shard/s586/sh/4ff409d3-1754-4d1f-8507-ea7780f1b1c4/cwK7hplOCDHfUdnjJhScKxOfGgGzVJDRz9nDTJY1vrBHYZkT2atVzeDnFQ cette expérience], des cultures initiales de nématodes de deux souches OGM différentes, toutes deux porteuses d'un gène marqueur qui fait "rouler" les animaux (en fait un gène de collagène muté, appelé ''rol-6'', sur un plasmide avec un marqueur de résistance au antibiotique) ont été cultivées jusqu'à la famine pendant une semaine, puis lavées des plaques avec de l'eau.
 +
 +
Voici une [https://drive.google.com/file/d/1LalApnyA56MxREW_ELxDNaYdRltnH4zB/view?usp=sharing vidéo "live" de 3 secondes montrant des vers "Roller"] provenant d'une de ces plaques affamées, avant d'être lavés.
 +
 +
Le liquide contenant les vers a été réparti dans trois tubes individuels et traité dans trois conditions : juste dans de l'eau, dans de l'eau de Javel à 10 % ou dans de l'eau de Javel à 100 %.
 +
 +
[[File:Comparison.jpg|thumb|essaies de validation dans le laboratoire P1]]
 +
L'image de droite montre une partie de l'expérience.
 +
 +
Dans l'image dessous à gauche, on peut voir les boîtes de Petri secondaires après les traitements, 3 jours après.
 +
 +
Sans Javel, les nombreux nématodes de souche 'FXKI' ont mangé toute leur nourriture (droit en haut), et même si la couche bactérienne est encore bien visible pour le souche TR1CB, il y a, sans Javel, beaucoup de vers. 
 +
 +
Après les traitements avec 10% ou 100% Javel, seulement le TR1CB à 10% a eu toujours des nématodes vivants.
 +
 +
[[File:Plate_imagep3.png|thumb|3 jours post traitements|alt=|left]]
 +
 +
 +
Toutes les boîtes de Petri ont été inactivées conformément au procédure opératoire standardisée après le troisième jour d'observation, comme d'habitude, avec de l'eau de Javel non diluée (2,5 % d'hypochlorite).
 +
 +
  
 
Un message important à retenir de la validation: les larves résistantes (au stade 'dauer') peuvent survivre à 10 % d'eau de Javel, mais 100 % d'eau de Javel utilisée [https://drive.google.com/file/d/1_db3H7Ybm_kd7yV-wnMKF55Snr805TAp/view?usp=sharing conformément à la procédure opératoire standardisée] tue tous les stades de ''C. elegans'' nématodes...
 
Un message important à retenir de la validation: les larves résistantes (au stade 'dauer') peuvent survivre à 10 % d'eau de Javel, mais 100 % d'eau de Javel utilisée [https://drive.google.com/file/d/1_db3H7Ybm_kd7yV-wnMKF55Snr805TAp/view?usp=sharing conformément à la procédure opératoire standardisée] tue tous les stades de ''C. elegans'' nématodes...
  
[[File:Postvalid nematodes.png|thumb|désinfection après le troisième jour...]]to add closeup worm plates!
+
Cette validation fait partie de nos [[LaboP1|mises à jour et révisions des procédures de biosécurité du laboratoire]].
 +
 
 +
Voici la [[OGMinact validation|validation similaire pour le cas des bactéries OGMs]].
 +
 
 +
 
 +
<nowiki>*</nowiki>
 +
 
 +
Les titres de tous nos pages de wiki ne sont pas toujours parfaite, mais le contenu peut être ameliorer par tout le monde aussi. C'est l'idée de la démarche de la science ouverte - de 'faire ensemble' ou 'Do-It-Together' ! =)

Latest revision as of 15:42, 27 November 2023

version FR (doit avoir 'nématodes' dans le titre dessus - bien sûr !)*

Voici le lien vers la version anglais.

Cette page est un résumé simplifié concernant la validation de la procédure opératoire standardisée utilisée pour inactiver les organismes génétiquement modifiés (OGM) à l'aide d'eau de Javel, en vue de leur utilisation sur des vers nématodes.


l'expérience de validation p1

l'expérience de validation p2


Pour cette expérience, des cultures initiales de nématodes de deux souches OGM différentes, toutes deux porteuses d'un gène marqueur qui fait "rouler" les animaux (en fait un gène de collagène muté, appelé rol-6, sur un plasmide avec un marqueur de résistance au antibiotique) ont été cultivées jusqu'à la famine pendant une semaine, puis lavées des plaques avec de l'eau.

Voici une vidéo "live" de 3 secondes montrant des vers "Roller" provenant d'une de ces plaques affamées, avant d'être lavés.

Le liquide contenant les vers a été réparti dans trois tubes individuels et traité dans trois conditions : juste dans de l'eau, dans de l'eau de Javel à 10 % ou dans de l'eau de Javel à 100 %.

essaies de validation dans le laboratoire P1

L'image de droite montre une partie de l'expérience.

Dans l'image dessous à gauche, on peut voir les boîtes de Petri secondaires après les traitements, 3 jours après.

Sans Javel, les nombreux nématodes de souche 'FXKI' ont mangé toute leur nourriture (droit en haut), et même si la couche bactérienne est encore bien visible pour le souche TR1CB, il y a, sans Javel, beaucoup de vers.

Après les traitements avec 10% ou 100% Javel, seulement le TR1CB à 10% a eu toujours des nématodes vivants.

3 jours post traitements


Toutes les boîtes de Petri ont été inactivées conformément au procédure opératoire standardisée après le troisième jour d'observation, comme d'habitude, avec de l'eau de Javel non diluée (2,5 % d'hypochlorite).


Un message important à retenir de la validation: les larves résistantes (au stade 'dauer') peuvent survivre à 10 % d'eau de Javel, mais 100 % d'eau de Javel utilisée conformément à la procédure opératoire standardisée tue tous les stades de C. elegans nématodes...

Cette validation fait partie de nos mises à jour et révisions des procédures de biosécurité du laboratoire.

Voici la validation similaire pour le cas des bactéries OGMs.


*

Les titres de tous nos pages de wiki ne sont pas toujours parfaite, mais le contenu peut être ameliorer par tout le monde aussi. C'est l'idée de la démarche de la science ouverte - de 'faire ensemble' ou 'Do-It-Together' ! =)